La distillerie Banff, première à porter ce nom, fut fondée en 1824 par James McKilligan & Co. à Banff Bay, Inverboyndie. La propriété passa à Alex Mackay en 1837, puis à James Simpson Sr. et Jr. en 1852. En 1863, James Simpson Jr. construisit une nouvelle installation à Inverboyndie avec un excellent accès ferroviaire via la Great North of Scotland Railway et de l'eau de source premium de la ferme Fiskaidly.
La distillerie subit de multiples catastrophes. Le 9 mai 1877, un incendie majeur détruisit la majeure partie de l'installation, sauf les entrepôts. Dès octobre 1877, Simpson reconstruisit et reprit les opérations, maintenant un camion de pompiers sur place. En 1921, la famille Simpson vendit une partie à la Mile End Distillery Company de Londres. En 1932, une filiale de Distillers Company Ltd. acheta l'ensemble de la distillerie pour £50 000 et cessa immédiatement la production.
Le 16 août 1941, un bombardier allemand Junkers Ju 88 détruisit l'entrepôt n° 12, brûlant de nombreux fûts de whisky et contaminant les réserves d'eau locales, empoisonnant le bétail selon les rapports. Les réparations commencèrent en hiver 1941, mais en 1943 le 248e squadron de la RAF occupa le site jusqu'à la fin de la guerre.
La restauration d'après-guerre se termina tragiquement le 3 octobre 1959, lorsqu'une explosion d'alambic pendant des réparations détruisit l'équipement et endommagea la distillerie, entraînant une amende de £15 pour violations de sécurité. Les opérations repriment, mais la distillerie ferma définitivement en 1983. À la fin des années 1980, la plupart des bâtiments furent démolis; le dernier entrepôt succomba à un incendie le 11 avril 1991.
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